La structuration actuelle de la Fondation se présente comme suit :
- La Direction Générale ;
- L’Unité Qualité et Réglementation ;
- L’Unité Chimie Environnementale avec son laboratoire d’analyse de résidus ;
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L’Unité Biologie :
- Laboratoire d’entomologie ;
- Laboratoire de vertébrés ;
- Laboratoire d’Hydrobiologie.
- L’Unité Administration Finances et Logistique.
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